Agnès Lecoq commence la flûte à bec à 11 ans auprès de Béatrice Tilloy avant d'entrer au CNR de Rouen, présentée par Ghislaine Broutin-Duménil. Après avoir suivi les Classes à Horaires AMénagés elle obtient son Baccalauréat F11 et entre au Conservatoire du 7ème arrondissement de Paris dans la classe de Claire Michon et de Sébastien Marq. Elle étudie ensuite aux Pays Bas auprès de Reine-Marie Verhagen et Léo Meilink et obtient son diplôme de Musicien Enseignant en 1996 au CNSM d'Utrecht. Elle suit des Masters Classes avec Marion Verbrüggen et participe à de nombreux stages. Elle étudie également la viole de Gambe avec Anneke Pols et participe à de nombreux concerts.

Actuellement professeur de flûte à bec à l'école de musique du Mesnil Esnard et à Mont Saint Aignan à l'association Les Ateliers Artistiques Normands où elle donne des cours individuels et collectifs.